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Laboratories of the RISE Competence Centre

daVEB-Lab
ICON
Digital Video Conferencing Laboratory
MeProLab
MOlecular Diagnostics & Life Sciences (MOD&LS)

daVEB-Lab

The daVEB-Lab is a laboratory of cell biology and manipulation of biological samples in support of the "da Vinci European Biobank" (biobank certified ISO9001 since 2011 for the "collection, conservation and distribution of biological samples and the data connected to them for scientific research"). The laboratory is flanked by the biobank repository, at the Sciences Campus of Sesto Fiorentino, for the management of cryopreservation, distribution, processing and molecular analysis services of biological samples and associated data.

Services

  • Distribution of biological samples, of its collections for research purposes.
  • Third party storage of biological samples (biofluids, tissues, cells, DNA, etc.) and associated data, and their backup.
  • DNA extraction from biological samples
  • Human cell cultures
  • Emergency plan support for small biobanks or repositories (disaster recovery plan)

Details of services in the daVEB webpage

The daVEB-Lab laboratory has at its disposal: Hamilton automated machine for DNA extraction that allows to process up to 384 samples simultaneously; CO2 incubator for cell cultures; laminar flow hood; microscope; refrigerated centrifuge. In addition, it has at its disposal the daVEB biobank storage area.

Manager
Paola Turano
Contacts
da Vinci European BioBank
Sesto Fiorentino Sciences Campus
Via L. Guerri, Edificio LAP e RISE A- 50019 Sesto Fiorentino (Firenze) Italy
Ph: +39 055. 457.3432
Email: daveb(AT)csavri.unifi.it

ICON

The ICON Center includes researchers and professional profiles experienced in biotechnology. There are physicists, biotechnologists, biomedical engineers, telecommunications engineers.
Thanks to the high-precision instrumentation it is equipped with, ICON digitizes (imaging) biological and non-biological samples on slides with various types of post-processing, including the development of ad hoc algorithms for the identification of some characteristics.
It also develops tools based on various techniques of artificial intelligence and analytical data, for an optimized management of processes and work flows, with a view to providing tools and services to support decision-making in various areas and with specific reference to technology transfer.

Services

  • digitization and characterization of samples on slide
  • development of automatic processing software for specific workflows
  • development of software tools to support the decision-making process
  • software maintenance services on the developed applications

The centre has a Raman Horiba Xplora INV microscope and a Zeiss Axio-Scan Z.1 scanning electron microscope.

Manager
Francesco Saverio Pavone
Contacts
Riccardo Cicchi
via Nello Carrara, 1 - 50019 Sesto Fiorentino (FI)
Ph+39 055 457 2482
email: rcicchi(AT)lens.unifi.it
Website

Digital Video Conferencing Laboratory

The Laboratory is equipped with a video conferencing structure - based on CISCO systems - which guarantees high quality multimedia connections and is located inside a room fitted with support equipment such as microphones, video cameras and a 55"(full HD) monitor for the integrated vision of the other venues connected by videoconference.
The room has also a table for the speakers involved in the videoconference and is able to welcome an audience of up to 60 people.

Services

The Cisco Telepresence SX20 HD Videoconferencing system with which the Laboratory is equipped is a flexible solution that allows users to easily transform any flat screen monitor into a powerful telepresence system, for small and medium meeting rooms. SX20 Quick Set offers high definition video quality, contemporary conference capability and three camera options to manage different room sizes and configurations.
The videoconferencing platform can be used to provide multimedia communication services for those who carry out activities that require remote connections to promote and manage their products nationally and internationally. The services provided can be scaled according to the level of quality required by the customer.
Manager
Roberto Caldelli
Contacts
tel. +39 055 2751391
roberto.caldelli(AT)unifi.it

MeProLab

MeProLab deals with: study of membrane proteins for the transport of ions; study of the interactions between drugs and membrane proteins; DNA study; analysis in the biotechnological, food, environmental and industrial fields.
MeProLab has 9 laboratories; some of them are used to house sophisticated measuring equipment; others constitute a facility for molecular biology.
Specifically, the centre is equipped with the following:

  • a biosafety level II laboratory for working with mammalian cells infected with adenovirus
  • a cold room at controlled temperature, to handle the biological material necessary for the extraction of wild-type proteins

The following equipment is available:

  • Patch-clamp system (MolecularDevices)
  • HPLC / DAD-FLD, Agilent 1100 Model with DAD and Fluorescence detectors for spectroscopic measurements
  • V-560 spectrophotometer
  • GELDOC ™ XR + System
    MeProLab collaborates with the BioElectroLab of the Chemistry Department and with NextGenomics.

Services

  • production and supply of membrane proteins and study of their interactions with new molecules of pharmacological interest (Ca-ATPase, Na, K-ATPase, phospholamban)
  • determination of the cardiotoxicity of molecules and nanoparticles
  • DNA analysis: analysis of genes for the determination of food and respiratory allergies and intolerances, DNA diagnostic probes
  • biological and biotechnological analysis: qualitative and quantitative analysis of proteins, peptides and amino acids, separation of DNA, RNA, polynucleotides
  • food analysis: components of natural foods, food additives, contaminants
  • analysis of the microbiome to support medical therapies
  • body composition analysis, with bioimpedance meter
  • nutritional training: educational nutritional courses aimed at middle and high schools
  • environmental analyses according to the Ministerial Decree 152/2006 for waters, soils, waste and work environments
  • development of new analysis protocols on request

Manager
Stefania Tegli, Francesco Tadini Buoninsegni
Contacts
Tel. 055 4573228 - 4573239 
stefania.tegli(AT)unifi.it

MOlecular Diagnostics & Life Sciences (MOD&LS)

MOlecular Diagnostics & Life Sciences is a molecular diagnostics competence centre based on innovative analysis technologies with a multidisciplinary approach. Starting from chemistry and physics, it is oriented towards biology and engineering with applications in the life sciences (biomedical sector), wellness (food, cosmetics and safety) and in the cultural heritage sector.

Services

  • development and validation of diagnostic methodologies and measurement of chemical, physical and biological parameters, responding, in addition, to the REACH (Registration, Evalutation, Authorization of Chemicals) parameters
  • analysis of diagnostic profiles in complex matrices (biological fluids, food, cosmetics, fabrics, algae-like biomass, etc.)
  • chromatographic analyses
  • environmental analyses
  • amino acid analyses
  • food and cosmetic analyses
  •  anti-doping analyses
  •  synthesis of peptides and small molecules (preparation of immunological probes, analytical standards, etc.)
  •  training activities in its areas of expertise

The centre has advanced instrumentation including:

  • Microwave solid phase peptide synthesizer (Liberty Blue, Cem) for Peptide Synthesis
  • Chromatograph coupled to a mass spectrometer (Uhplc-Ms) (Thermo - Dionex) for Characterization
  • 20m3 scroll pump (5-Pascal)
  • 6m3 scroll pump (5-Pascal)
  • Plate washer and plate reader (Tecan) for Biomolecules Detection
  • 120 cm microbiological safety cabinet and support with wheels, equipped with UV lamp and wheeled support for Molecular biology
  • Laboratory fridge Temp. +2 a +20°C;
  • Laboratory freezer Temp. -5 a -25°C. Vertical double door total capacity 250 l
  • LIO-5P bench freeze dryer with fittings for vacuum scroll
  • pump Rotavapor with vertical glassware
  • Biacore T 100 (Ge Healthcare) for Biomolecules Detection

Manager
Anna Maria Papini
Contacts
Tel. 055 4573651
annamaria.papini(AT)unifi.it

 

daVEB-Lab

Il daVEB-Lab è un laboratorio di biologia cellulare e manipolazione di campioni biologici a supporto della “da Vinci European Biobank” (biobanca certificata ISO9001 dal 2011 per la "raccolta, conservazione e distribuzione di campioni biologici e dei dati ad essi collegati per la ricerca scientifica"). Il laboratorio è affiancato al repositorio della biobanca, presso il Polo Scientifico di Sesto Fiorentino, per la gestione di servizi di crioconservazione, distribuzione, processamento e analisi molecolare di campioni biologici e dati associati.

Servizi

  • Distribuzione di campioni biologici, delle sue collezioni per scopi di ricerca.
  • Stoccaggio conto terzi di campioni biologici (biofluidi, tessuti, cellule, DNA, ecc.) e dati associati, anche in backup.
  • Estrazione di DNA da campioni biologici
  • Colture cellulari umane
  • Supporto al piano di emergenza di piccole biobanche o repositori (disaster recovery plan)

Dettaglio servizi

Il laboratorio daVEB-Lab ha a disposizione: macchina automatizzata Hamilton per estrazione di DNA che consente di processare simultaneamente fino a 384 campioni; incubatore a CO2 per colture cellulari; cappa a flusso laminare; microscopio; centrifuga refrigerata. Inoltre si avvale dell’area stoccaggio biobanca daVEB.

Responsabile

Paola Turano

Contatti

da Vinci European BioBank 
Polo Scientifico di Sesto Fiorentino 
Via L. Guerri, Edificio LAP e RISE A - 50019 Sesto Fiorentino (Firenze) Italia 
Telefono: +39 055. 457.3432 
Email: daveb(AT)csavri.unifi.it

Sito web

ICON

Al Centro ICON afferiscono ricercatori e profili professionali esperti nell’area biotecnologica. Vi sono fisici, biotecnologi, ingegneri biomedici, ingegneri delle telecomunicazioni. 
Grazie alla strumentazione di alta precisione di cui è dotato, ICON effettua digitalizzazione (imaging) di campioni biologici e non, su vetrino, con varie tipologie di post-processing, anche con sviluppo di algoritmi ad hoc per l’identificazione di alcune caratteristiche. 
Sviluppa inoltre strumenti basati su varie tecniche di intelligenza artificiale e analitica dei dati, per una gestione ottimizzata di processi e flussi di lavoro, nell’ottica di fornire strumenti e servizi di supporto alla decisione in vari ambiti e con specifico riferimento al trasferimento tecnologico.

Servizi

  • digitalizzazione e caratterizzazione di campioni su vetrino
  • sviluppo di software di elaborazione automatica per specifici flussi di lavoro
  • sviluppo di strumenti software di supporto alla decisione
  • servizi di manutenzione software sugli applicativi sviluppati

Il centro dispone di microscopio Raman Horiba Xplora INV e microscopio scanner digitale Zeiss Axio-Scan Z.1     

Responsabile

Francesco Saverio Pavone

Contatti
Riccardo Cicchi, [email protected]
Via Nello Carrara, 1 - 50019 Sesto Fiorentino (FI) 
tel +39 055 457 2482 
email: rcicchi(AT)lens.unifi.it 

Sito web

Laboratorio Digitale di Videoconferenza

Il Laboratorio è dotato di una struttura di videoconferenza - basata su sistemi CISCO - che garantisce collegamenti multimediali a elevata qualità ed è collocata all’interno di una sala dotata di attrezzature di supporto quali microfoni, videocamere e un monitor 55" (full HD) per la visione integrata delle sedi collegate in videoconferenza. 
La sala dispone inoltre di un tavolo per gli speaker, coinvolti nella videoconferenza, ed è in grado di accogliere un’audience fino a circa 60 persone sedute.

Servizi

Il sistema di Videoconferenza HD Cisco Telepresence SX20 di cui è dotato il Laboratorio è una soluzione flessibile che consente di trasformare facilmente qualsiasi monitor a schermo piatto in un sistema di telepresenza potente, per le piccole e medie sale riunioni. SX20 Quick Set offre qualità video ad alta definizione, possibilità di conferenza contemporanea e tre opzioni della fotocamera per gestire differenti dimensioni della stanza e configurazioni. 
La piattaforma di videoconferenza può essere utilizzata per erogare servizi di comunicazione multimediale per quanti svolgono attività che richiedono collegamenti a distanza per promuovere e gestire i propri prodotti in campo nazionale e internazionale. I servizi erogabili possono essere scalati in base al livello di qualità richiesto dal cliente.

Responsabile

Roberto Caldelli

Contatti
tel. +39 055 2751391 
roberto.caldelli(AT)unifi.it

MeProLab

MeProLab si occupa di: studio di proteine di membrana per il trasporto di ioni, studio delle interazioni tra farmaci e proteine di membrana; studio di DNA; analisi in campo biotecnologico, alimentare, ambientale e industriale. 
MeProLab è costituito da 9 laboratori; alcuni di essi sono adibiti a ospitare sofisticate apparecchiature di misura; altri costituiscono una facility per biologia molecolare. In particolare il centro è dotato di:

  • un laboratorio a livello di biosicurezza II, per lavorare con cellule di mammiferi infettate con adenovirus
  • una camera fredda a temperatura controllata, per manipolare il materiale biologico necessario per l’estrazione di proteine wild-type

Il Centro dispone delle seguenti attrezzature:

  • sistema di Patch-clamp (MolecularDevices)
  • HPLC/DAD-FLD, Modello Agilent 1100 con rivelatori DAD e Fluorescenza per misure spettroscopiche
  • Spettrofotometro V-560
  • GelDoc™XR+System

Servizi

  • produzione e fornitura di proteine di membrana e studio delle loro interazioni con nuove molecole di interesse farmacologico (Ca-ATPasi, Na,K-ATPasi, fosfolambano)
  • determinazione della cardiotossicità di molecole e nano particelle
  • analisi del DNA: analisi di geni per la determinazione di allergie e intolleranze alimentari e respiratorie, sonde diagnostiche a DNA
  • analisi biologiche e biotecnologiche: analisi quali-quantitativa di proteine, peptidi e amino acidi, separazione di DNA, RNA, polinucleotidi
  • analisi alimentari: componenti di alimenti naturali, additivi alimentari, contaminanti
  • analisi del microbioma per affiancare le terapie mediche
  • analisi di composizione corporea, con bioimpedenziometro
  • training nutrizionale: percorso nutrizionale educativo diretto alle scuole medie inferiori e superiori
  • analisi ambientali secondo il D.M. 152/2006 per acque, suoli, rifiuti e ambienti di lavoro
  • messa a punto di nuovi protocolli di analisi su richiesta

Comitato di Gestione

  • Barbara Valtancoli
  • Debora Berti
  • Marco Pierini

Referenti Tecnici

  • Patrizia Andreozzi
  • Demetrio Randazzo
  • Francesco Tadini

Contatti

  • Tel. 055 - 4573435
  • e-mail: meprolab(AT)chim.unifi.it

MOlecular Diagnostics & Life Sciences (MOD&LS)

MOlecular Diagnostics & Life Sciences è un centro di competenza di diagnostica molecolare basato su tecnologie di analisi innovative con approccio multidisciplinare. Partendo dalla chimica e dalla fisica è orientato verso la biologia e l’ingegneria con applicazioni nelle Scienze della vita (settore biomedico), del benessere (alimenti, cosmetici e sicurezza) e nel settore dei beni culturali.

Servizi

  • messa a punto e validazione di metodologie diagnostiche e di misura di parametri chimici, fisici e biologici, rispondendo anche ai parametri del REACH (Registration, Evalutation, Autorisation of Chemicals)
  • analisi di profili diagnostici in matrici complesse (fluidi biologici, alimenti, cosmetici, tessuti, biomasse tipo alghe, ecc.)
  • analisi cromatografiche
  • analisi ambientali
  • analisi amminoacidi
  • analisi alimenti e cosmetici
  • analisi anti-doping
  • sintesi di peptidi e piccole molecole (preparazione sonde immunologiche, standard analitici, ecc.)
  • attività di formazione nei settori di competenza

Il centro dispone di una strumentazione avanzata e composta da:

  • Sintetizzatore di peptidi in fase solida a microonde (Liberty Blu, Cem) for Peptide Synthesis
  • Cromatografo accoppiato ad uno spettrometro di massa (Uhplc-Ms) (Thermo - Dionex) for Characterization
  • Pompa scroll da 20m3 (5-Pascal )
  • Pompa scroll da 6m3 (5-Pascal )
  • Lavatore di Piastre e lettore di Piastre (Tecan) for Biomolecules Detection
  • Cabina sicurezza microbiologica 120 cm e supporto con ruote, munita di lampada UV e supporto con ruote for  Molecular biology
  • Frigorifero per laboratorio Temp. +2 a +20°C;
  • Congelatore per laboratorio Temp. -5 a -25°C. Doppio sportello capacità totale 250 litri verticale
  • Liofilizzatore da banco completo di raccordi per pompa scroll a vuoto LIO-5P
  • Rotavapor con vetreria verticale
  • Biacore T 100 (Ge Healthcare) for Biomolecules Detection

Responsabile

Anna Maria Papini
 Contatti
Tel. 055 4573651 
annamaria.papini(AT)unifi.it